Dessalage des peptides
Purification et dessalage des peptides dans les approches protéomiques ascendantes avec les kits BioSPE® PurePep.
BioSPE® PurePep est utilisé pour un dessalage efficace des peptides après digestion enzymatique, avant l’analyse LC-MS/MS. Jusqu’à 97% des protéines sont identifiées après dessalage du digest HeLa sur BioSPE® PurePep, avec une bonne récupération des peptides sur toute la gamme de polarité, et une bonne répétabilité (RSD < 3%).
Pour le dessalage des peptides les plus hydrophiles, nous recommandons l’utilisation de BioSPE® PurePep Broad, qui peut retenir efficacement les petits peptides polaires. BioSPE® PurePep Broad est également stable dans des conditions de pH extrêmes (pH 0-14) et peut s’assécher pendant le processus SPE sans conséquences sur vos résultats.
Les kits BioSPE® PurePep et BioSPE® PurePep Broad sont composés de :
- Colonnes de dessalage
- Adaptateurs (pour la centrifugation des pointes) et/ou outils de collecte (tubes à centrifuger ou plaques de collecte). Chaque kit contient deux outils de collecte (un pour les étapes de conditionnement/chargement/lavage et un pour l’étape d’élution)
- Un protocole détaillé pour un dessalage rapide et facile
Pour déterminer le format et la capacité qui répondront le mieux à vos besoins, veuillez vous reporter aux tableaux de l’onglet « Formats et capacités ».
- Aucune contrainte de stockage (conserver au sec à température ambiante)
- Différents formats SPE disponibles pour s’adapter au volume et au débit des échantillons (Tips, colonnes Spin, plaques 96 & 384 puits, cartouches)
- Deux capacités disponibles pour chaque format en fonction de votre quantité de peptides
Détails concernant les volumes de chargement et d’élution de nos différents produits BioSPE® PurePep pour trouver le meilleur produit en fonction du volume de votre échantillon.
Tableau d’information concernant les capacités (quantité maximale de peptides/protéines pouvant être retenue) de nos différents produits BioSPE® PurePep :
- Pour une capacité standard, les références des produits contiennent la lettre S (ex : Tips-PurePep.S.200.96).
- Pour une capacité élevée, les références des produits contiennent la lettre H (ex. Tips-PurePep.H.200.96).
Littérature
Hijazi, H. et al. (2025) ‘Mind Your Spectra: Points to be Aware of When Validating the Identification of Isobaric Histone Peptidoforms’, Journal of Proteome Research.
Dans leur dernière publication, Hassan M. Hijazi et al. ont étudié l’identification de variants d’histone H3mm7 et H3mm13 spécifiques aux souris, provenant d’extraction du cerveau et testicules, par LC-MS/MS.
Pour permettre une détection améliorée des modifications post-traductionnel comme l’acétylation et lactylation, la purification de peptides a été réalisée avec la gamme Affinisep BioSPE® PurePep. Ceci permet l’obtention d’une haute efficacité de suppressions d’interférences, tout en préservant les peptides modifiés.
Cette approche a permis l’amélioration de la qualité des spectres MS/MS, particulièrement pour des ions critiques tels que b1 et Cyclm. Ceci a contribué à relever les défis liés aux variants isobares, causés par le manque de contrôle des modifications comme la propionylation.
Produit utilisé : BioSPE® PurePep Tips 200µl (Ref: KT-Adapt-Tips-PurePep.H.200.96)
Notes d’application
- Protéomique
Estimation of the working range on BioSPE™PurePep SPE Tips – Standard capacity
Nouveau !
Peptide desalting with BioSPE™ PurePep
Fractionnement des peptides
Amélioration de l’identification des protéines par LC-MS/MS dans des échantillons biologiques complexes tels que le plasma par fractionnement des peptides à pH basique.
Elimination des billes magnétiques
Élimination des billes magnétiques des échantillons après la préparation d’un échantillon à un seul pot et à phase solide (SP3).
Purification des protéines intactes
Purification de protéines intactes dans les approches protéomiques descendantes.
Enrichissement des glycopeptides
Purification et enrichissement des glycanes et des glycopeptides.
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